رضا نصری در پاسخ به این سوال که آیا جمهوری اسلامی واکنش به اقدام اسرائیل در ترور اسماعیل هنیه در خاک ایران را به جریان مقاومت خواهد سپرد می‌گوید: طبیعتاً، ایران اختیارات و حقوق ذاتی خود- از جمله حق دفاع مشروعش- را برون‌سپاری نخواهد کرد.
سخنگو و معاون روابط عمومی سپاه با بیان اینکه ترور شهید اسماعیل هنیه در تهران نقض آشکار منشور سازمان ملل بود، گفت: رژیم صهیونیستی در زمان مشخص پاسخ این حماقت را دریافت خواهد کرد.
مشاور سیاسی رهبری انقلاب اسلامی گفت: فرآیندهای حقوقی، دیپلماتیک و رسانه‌ای طی‌شده، مقدمات تنبیه شدید رژیم صهیونیستی که جز زبان زور نمی‌فهمد را فراهم کرده است.
خطیب نماز جمعه تهران گفت: معنای خونخواهی از خون هنیه، انتقام سخت از رژیم صهیونیستی است، اما اینکه کی، چگونه و کجا بزنیم با تدبیر مقامات ایران انجام می‌شود. مقامات رژیم صهیونیستی را در اضطراب نگه می‌داریم، اما انتقام جانانه می‌گیریم.
فرمانده نیروی قدس سپاه پاسداران انقلاب اسلامی گفت: همان طور که رهبر انقلاب فرمودند وظیفه خود می‌دانیم که انتقام خون شهید هنیه را برای این حادثه تلخ در جمهوری اسلامی بگیریم.
مقام ارشد آمریکایی به تهدید ایران درباره پاسخ به رژیم صهیونیستی در پی ترور رئیس دفتر سیاسی حماس در تهران گفت: «وقتی ایرانی‌ها می‌گویند می‌خواهند پاسخ دهند، حرف آن‌ها را می‌پذیریم».
سرپرست وزارت خارجه ایران گفت: ترور بزدلانه اسماعیل هنیه، مصداق روشن قتل خودسرانه و نقض فاحش حقوق‌بشر است. چنین تعرض و تعدی‌ای به هیچ عنوان نمی‌تواند بدون پاسخ بماند. پاسخ جمهوری اسلامی ایران قطعی و قاطع خواهد بود.
به دنبال ترور اسماعیل هنیه، رئیس دفتر سیاسی حماس مقامات ایران از پاسخ قطعی به اسرائیل خبر داده اند. مدیرکل خاورمیانه وزارت خارجه در دولت اصلاحات معتقد است که هدف موشکی که به اتاق اسماعیل هنیه در تهران خورد، دوگانه بود؛ یکی شخص هنیه و دوم قلب برنامه‌های اصلاحی دولت پزشکیان.
سخنگوی کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس گفت: در مورد ترور شهید هنیه اقدامات لازم جهت بررسی موضوع ترور و تکمیل اطلاعات در حال انجام است و رسیدن به اطلاعات کامل مستلزم بررسی دقیق است.»
