موضوع نحوه تعیین و پرداخت مالیات ارزش افزوده اوراق شمش نقره در گذشته برای افراد ابهام‌آمیز بود. با تصویب قانون تامین مالی تولید و اضافه شدن ماده 10 به آن، موضوع مالیات ارزش افزوده حل شد.
هزینه انبارداری و نگهداری به ازای هر گواهی سپرده کالایی شمش نقره روزانه معادل ۲۰ ریال است. هزینه مزبور ابتدای فصل بهار و پاییز، طبق میانگین قیمت پایانی نماد معاملاتی در ماه پایانی تعدیل می‌شود. پرداخت این مبلغ بر عهده دارنده گواهی سپرده کالایی در پایان هر روز است.
برای خرید گواهی شمش نقره، مشتری باید وجه مورد نظر را به حساب بانکی کارگزاری واریز کند. همچنین مشتری باید برای تامین وجه در دفتر دارایی خود در سامانه معاملات، درخواست دهد.
